Le CIC-IT est piloté via un comité stratégique annuel, impliquant les coordonnateurs, les représentants des tutelles, le directeur de la PTIB et les membres scientifiques. Les coordonnateurs des modules EC et P sont également conviés. Un bilan d'activité y est présenté et les orientations scientifiques et stratégiques futures y sont déterminées. Les nouveaux projets soumis au CIC-IT sont présentés au comité technique mensuel regroupant toute l'équipe, le représentant valorisation de la SATT et de l'INSERM, et les porteurs des nouveaux projets si nécessaire. Le Comité Technique a pour missions :

• D'examiner les études proposées, d'en évaluer la faisabilité méthodologique et logistique, d'en prévoir l'exécution. La sélection des projets soumis au CIC-IT repose sur la pertinence de la question posée, l'adéquation de la méthodologie proposée, le respect de l'éthique, de la réglementation et de bonnes pratiques cliniques, et sur l'adéquation entre le projet et les missions du CIC-IT.
• De suivre l'exécution des projets acceptés.
• De faciliter la collaboration entre les différents acteurs de la recherche clinique au CHU et de favoriser la recherche translationnelle.
• De préparer la réponse aux appels d'offres.